MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Campylobacter jejuni subsp. jejuni ICDCCJ07001 plasmid pTet

Total Repeats: 284

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014801	A	6	6	83	88	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014801	CTA	2	6	500	505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014801	TAA	2	6	512	517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014801	TAA	2	6	529	534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014801	AT	4	8	541	548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014801	TAAT	2	8	549	556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014801	ATA	2	6	575	580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014801	TA	3	6	582	587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014801	TA	4	8	590	597	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014801	TAG	2	6	1038	1043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014801	T	6	6	1057	1062	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014801	TTTA	2	8	1078	1085	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014801	TTAT	2	8	1137	1144	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014801	TTA	2	6	1152	1157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014801	AAAG	2	8	1193	1200	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014801	AGA	2	6	1207	1212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014801	TAA	2	6	1238	1243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014801	AGAT	2	8	1252	1259	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014801	AAT	2	6	1260	1265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014801	AAAC	2	8	1289	1296	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014801	TAA	2	6	1340	1345	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014801	ATG	2	6	1357	1362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014801	TTA	2	6	1380	1385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014801	GAA	2	6	1440	1445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014801	ATTT	2	8	1500	1507	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014801	TTA	2	6	1515	1520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014801	TA	3	6	1532	1537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014801	A	6	6	1555	1560	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014801	T	7	7	1563	1569	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014801	A	8	8	2138	2145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014801	A	6	6	2189	2194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014801	A	6	6	2212	2217	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014801	AAG	2	6	2250	2255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014801	TAG	2	6	2264	2269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014801	A	6	6	2305	2310	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014801	GATTTA	2	12	2317	2328	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014801	TA	3	6	2347	2352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014801	A	6	6	2421	2426	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014801	TTA	2	6	8271	8276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014801	TTC	2	6	8364	8369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014801	CT	3	6	8370	8375	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014801	TCT	2	6	8380	8385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014801	GCT	2	6	8392	8397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014801	TTC	3	9	8402	8410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014801	GCT	2	6	8428	8433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014801	GTCTT	2	10	8437	8446	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_014801	TCA	2	6	8558	8563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014801	T	6	6	8610	8615	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014801	CT	3	6	8628	8633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
50	NC_014801	TTC	2	6	8634	8639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014801	ACC	2	6	8646	8651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_014801	TACA	2	8	9203	9210	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014801	TCT	2	6	9215	9220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014801	ACAG	2	8	9259	9266	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014801	ATT	2	6	9411	9416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014801	GAT	2	6	9429	9434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014801	TAT	2	6	9521	9526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014801	TAA	2	6	9536	9541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014801	TAAA	2	8	9561	9568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014801	T	6	6	9632	9637	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014801	T	6	6	9762	9767	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014801	AGG	2	6	9778	9783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014801	ATG	2	6	11763	11768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014801	TAA	2	6	11813	11818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014801	T	7	7	11844	11850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014801	GAT	2	6	11852	11857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014801	GAAA	2	8	11903	11910	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014801	CGC	2	6	11971	11976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_014801	ATC	2	6	11978	11983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014801	TG	3	6	11992	11997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014801	GTT	2	6	12001	12006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014801	AAAAT	2	10	12019	12028	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014801	ATTTT	2	10	12108	12117	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014801	A	6	6	12151	12156	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014801	AG	3	6	12183	12188	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014801	TTTTTA	2	12	12231	12242	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014801	ATA	2	6	12247	12252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014801	TGAAA	2	10	12294	12303	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014801	CGCGTG	2	12	12397	12408	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014801	AC	4	8	12413	12420	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014801	A	6	6	12427	12432	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014801	TA	3	6	12443	12448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014801	A	6	6	12489	12494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014801	T	6	6	12510	12515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014801	T	6	6	12554	12559	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014801	GTTT	2	8	12563	12570	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014801	T	6	6	12574	12579	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014801	TTA	2	6	12589	12594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014801	T	6	6	12598	12603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014801	ATT	2	6	12623	12628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014801	T	6	6	12650	12655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014801	AAT	2	6	13587	13592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014801	ATA	2	6	13608	13613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014801	A	7	7	13618	13624	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014801	TA	3	6	13630	13635	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014801	ATA	2	6	13644	13649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014801	T	6	6	13657	13662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014801	AT	3	6	13668	13673	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014801	T	6	6	15660	15665	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014801	ATT	2	6	15713	15718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014801	ATT	2	6	15739	15744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014801	ACT	2	6	15765	15770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014801	ATA	2	6	15776	15781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014801	AAAG	2	8	15818	15825	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014801	AGA	2	6	15835	15840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014801	ATG	2	6	15855	15860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014801	A	7	7	15868	15874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014801	AAAAAG	2	12	15882	15893	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014801	TA	4	8	15907	15914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014801	A	6	6	15914	15919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014801	AAAT	2	8	15948	15955	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014801	AATTT	2	10	15972	15981	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014801	ATAAA	2	10	16026	16035	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014801	A	7	7	16081	16087	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014801	AT	3	6	18005	18010	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014801	A	6	6	18011	18016	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014801	T	6	6	18019	18024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014801	AT	3	6	18025	18030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014801	TAA	2	6	18038	18043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014801	TAT	2	6	18049	18054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014801	A	6	6	18072	18077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014801	TTA	2	6	18124	18129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014801	TGCT	2	8	18143	18150	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014801	A	6	6	18188	18193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014801	AG	3	6	18348	18353	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014801	AAAT	2	8	18382	18389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014801	A	6	6	18410	18415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014801	A	6	6	18423	18428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014801	AAT	2	6	18459	18464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014801	CTCTT	2	10	18484	18493	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_014801	TTA	2	6	18494	18499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014801	A	6	6	18584	18589	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014801	GAAA	2	8	18597	18604	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014801	A	6	6	18647	18652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014801	A	6	6	18656	18661	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014801	TAA	2	6	18735	18740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014801	T	6	6	18838	18843	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014801	AATTTT	2	12	18860	18871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014801	TAA	2	6	18901	18906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014801	T	7	7	18945	18951	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014801	ATT	2	6	18996	19001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014801	ATT	2	6	19017	19022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014801	TTG	2	6	19071	19076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014801	A	7	7	19120	19126	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014801	TGC	2	6	19135	19140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_014801	ATTT	2	8	19171	19178	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014801	ATC	2	6	19216	19221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_014801	ATT	3	9	19254	19262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014801	GGAT	2	8	19274	19281	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014801	GAA	2	6	19335	19340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014801	AAG	2	6	19357	19362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014801	TTTA	2	8	19372	19379	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014801	GAA	2	6	19395	19400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014801	A	6	6	19399	19404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014801	ATT	2	6	19407	19412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014801	ATT	2	6	19431	19436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014801	AAG	2	6	19481	19486	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014801	A	6	6	19552	19557	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_014801	AAC	2	6	19619	19624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_014801	TA	3	6	21487	21492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_014801	CTT	2	6	21502	21507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_014801	TTA	2	6	21534	21539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_014801	T	6	6	21545	21550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_014801	TAAA	2	8	21561	21568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014801	A	6	6	21566	21571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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168	NC_014801	TAAA	2	8	22961	22968	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_014801	AAT	2	6	22977	22982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_014801	AATTA	2	10	23005	23014	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_014801	T	7	7	23015	23021	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_014801	TAA	3	9	23025	23033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_014801	T	7	7	23054	23060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_014801	AAAAT	2	10	23079	23088	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_014801	TTA	2	6	23103	23108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_014801	TGG	2	6	23192	23197	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_014801	A	6	6	27829	27834	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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187	NC_014801	TCT	2	6	27921	27926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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189	NC_014801	AAG	2	6	27934	27939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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235	NC_014801	TAA	2	6	41431	41436	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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271	NC_014801	A	6	6	43848	43853	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_014801	T	6	6	43868	43873	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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274	NC_014801	A	6	6	43893	43898	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_014801	AGA	2	6	43915	43920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
276	NC_014801	A	7	7	43920	43926	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_014801	AGA	2	6	43930	43935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_014801	TTTA	2	8	43951	43958	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_014801	A	6	6	43967	43972	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
280	NC_014801	ATTT	2	8	43986	43993	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
281	NC_014801	AGTA	2	8	44005	44012	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
282	NC_014801	TAT	2	6	44015	44020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_014801	TGA	2	6	44055	44060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
284	NC_014801	ATA	2	6	44064	44069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.